Generación de clústeres simplificada con el cBot de Illumina
El cBot de Illumina desempeña un papel fundamental en el flujo de trabajo de secuenciación de nueva generación, sustituyendo los métodos tradicionales y laboriosos por una solución automatizada, compacta y eficaz. Este sistema permite crear clústeres clonales a partir de plantillas de ADN monocatenario mediante amplificación isotérmica en puente realizada directamente en una célula de flujo sellada, lo que evita la manipulación frecuente y los riesgos de contaminación asociados a los métodos de PCR en emulsión.
El cBot permite preparar plantillas de secuenciación a partir de más de 96 muestras en solo 4-5 horas, frente a las más de 24 horas que requieren las técnicas más antiguas. El tiempo de intervención manual es inferior a 10 minutos, lo que libera tiempo para otras actividades en el laboratorio. Su software intuitivo, combinado con una pantalla táctil de 8 pulgadas, ofrece una navegación guiada paso a paso y una supervisión en tiempo real del progreso. También es posible supervisar y gestionar varios cBot de forma remota a través de un navegador o un smartphone, con notificaciones que se envían cuando finaliza el ciclo o es necesaria una intervención.
El sistema se basa en reactivos TruSeq preenvasados en placas de 96 pocillos, lo que elimina los errores de preparación, las complejas necesidades de almacenamiento y las posibles fuentes de contaminación. La integración de un colector de perforación automática y conexiones térmicas uniformes contribuye a una densidad óptima de los clústeres, sin necesidad de añadir equipos externos. La generación de clústeres da como resultado más de 200 millones de agregados por celda de flujo, cada uno con aproximadamente 1000 moléculas, listos para ser secuenciados con gran precisión.
El proceso se basa en la inmovilización del ADN en una superficie funcionalizada, seguida de una amplificación clonal, un bloqueo de los extremos 3' y la hibridación del cebador de secuenciación. Gracias a esta rigurosa metodología, el cBot garantiza una producción eficaz, reproducible y fiable de modelos de ADN para las plataformas de secuenciación Illumina.
