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Sistema de sequenciamento Ion PGM System

O sistema Ion PGM™ da Thermo Fisher Scientific é uma solução de sequenciamento destinada à investigação biomédica, microbiológica e genómica. Oferece sequenciamento fiável com flexibilidade de fluxo através da utilização de diferentes chips (Ion 314, 316, 318). Concebido para laboratórios de investigação, o sistema permite análises específicas de ADN e ARN, com processamento de dados integrado através do software Torrent Suite™. O seu design compacto, desempenho reprodutível e múltiplas aplicações tornam-no uma ferramenta essencial para projetos de investigação que exigem precisão e adaptabilidade.



Descrição

Ion PGM™ System: um sistema de sequenciamento flexível para pesquisas biomédicas precisas

O Ion PGM™ System da Thermo Fisher Scientific é uma plataforma de sequenciamento que atende às necessidades dos investigadores envolvidos no estudo de doenças humanas, genómica microbiana ou análise de ADN antigo. Ele se destaca pela capacidade de fornecer resultados confiáveis e reproduzíveis, ao mesmo tempo em que se adapta a uma variedade de aplicações graças a uma ampla gama de chips e soluções de software integradas. O sistema é particularmente utilizado nas áreas de investigação sobre cancro, doenças hereditárias, epigenómica, metagenómica e genómica agrícola.

O sequenciador Ion PGM™ permite executar protocolos de sequenciamento direcionado de ADN e ARN, realizar análises de número de cópias, sequenciarde novo genomas microbianos ou proceder à tipagem bacteriana e viral. Também suporta a verificação de SNP, sequenciamento de pequenos ARNs, análises ChIP e metilação. Para responder a estas necessidades, estão disponíveis várias soluções de seleção de alvos, tais como as tecnologias Ion AmpliSeq™ ou Ion TargetSeq™, bem como kits de preparação de bibliotecas compatíveis com até 384 códigos de barras através do software Torrent Suite™.

O sistema é composto por dois elementos: o sequenciador Ion PGM™ e o servidor Ion Torrent™, na forma de uma torre de computador autónoma. Este último executa o processamento de sinais, a chamada de bases, o alinhamento e a identificação de variantes. O software Ion Reporter™ pode ser utilizado em complemento para fornecer uma anotação e um relatório detalhado dos resultados, adaptados a análises simples ou comparativas (por exemplo, tumor normal vs. tumor mutado).

Com o seu design compacto e compatibilidade com vários tipos de chips, o Ion PGM™ permite aos utilizadores escolher o nível de fluxo mais adequado aos seus projetos: de algumas centenas de milhares a vários milhões de leituras por sequência. A sua facilidade de utilização, compatibilidade com vários kits e softwares, bem como a sua adaptabilidade, tornam este sistema uma escolha estratégica para laboratórios que procuram uma plataforma de sequenciamento de alto desempenho sem sacrificar a flexibilidade.

Características

  • Tipos de chips compatíveis: Ion 314, Ion 316 e Ion 318 (versão v2 ou v2 BC)
  • Taxa de leitura: de 400 000 a 5,5 milhões de leituras, dependendo do chip utilizado
  • Duração das execuções: entre 2,3 h e 7,3 h, dependendo do comprimento dos fragmentos (200 ou 400 bases)
  • Produção de dados: de 30 Mb a 2 Gb, dependendo do chip
  • Formatos de saída: FASTQ, SFF, BAM, VCF
  • Aplicações suportadas: sequenciamento direcionado de ADN/ARN, sequenciamento microbiano de novo, tipagem, SNP, metilação
  • Análise de dados: Torrent Suite™ Software (análise primária), Ion Reporter™ Software (análise secundária)

Detalhes técnicos

  • Temperatura de funcionamento: 20 a 25 °C (68 a 77 °F)
  • Humidade: 40–60 %, sem condensação
  • Altitude: inferior a 2000 m
  • Conexão de gás: nitrogénio, grau 4.5 (≥99,995%), 35–45 psi, conexão de 0,25"
  • Dimensões: 61 x 51 x 53 cm (L x P x A)
  • Peso: 30 kg (sequenciador apenas)
  • Potência: 100–240 V, 50/60 Hz, consumo 200–300 W
  • Interfaces: Ethernet 1 GigE, 2 portas USB 2.0
  • Espaço livre necessário: 30,5 cm na parte traseira, 10 cm nas laterais, 90 cm na parte frontal

Acessórios compatíveis

  • Sistema Ion Chef™: automatização da preparação
  • Sistema Ion OneTouch™ 2: enriquecimento de bibliotecas
  • Kits de biblioteca: Ion AmpliSeq™, Ion Xpress™, Ion Total RNA-Seq v2
  • Soluções de direcionamento: Ion AmpliSeq™, Ion TargetSeq™
  • Kits de normalização e código de barras: Ion Library Equalizer™, 384 barcodes Torrent Suite™

Logística

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