Ion PGM™ System: um sistema de sequenciamento flexível para pesquisas biomédicas precisas
O Ion PGM™ System da Thermo Fisher Scientific é uma plataforma de sequenciamento que atende às necessidades dos investigadores envolvidos no estudo de doenças humanas, genómica microbiana ou análise de ADN antigo. Ele se destaca pela capacidade de fornecer resultados confiáveis e reproduzíveis, ao mesmo tempo em que se adapta a uma variedade de aplicações graças a uma ampla gama de chips e soluções de software integradas. O sistema é particularmente utilizado nas áreas de investigação sobre cancro, doenças hereditárias, epigenómica, metagenómica e genómica agrícola.
O sequenciador Ion PGM™ permite executar protocolos de sequenciamento direcionado de ADN e ARN, realizar análises de número de cópias, sequenciarde novo genomas microbianos ou proceder à tipagem bacteriana e viral. Também suporta a verificação de SNP, sequenciamento de pequenos ARNs, análises ChIP e metilação. Para responder a estas necessidades, estão disponíveis várias soluções de seleção de alvos, tais como as tecnologias Ion AmpliSeq™ ou Ion TargetSeq™, bem como kits de preparação de bibliotecas compatíveis com até 384 códigos de barras através do software Torrent Suite™.
O sistema é composto por dois elementos: o sequenciador Ion PGM™ e o servidor Ion Torrent™, na forma de uma torre de computador autónoma. Este último executa o processamento de sinais, a chamada de bases, o alinhamento e a identificação de variantes. O software Ion Reporter™ pode ser utilizado em complemento para fornecer uma anotação e um relatório detalhado dos resultados, adaptados a análises simples ou comparativas (por exemplo, tumor normal vs. tumor mutado).
Com o seu design compacto e compatibilidade com vários tipos de chips, o Ion PGM™ permite aos utilizadores escolher o nível de fluxo mais adequado aos seus projetos: de algumas centenas de milhares a vários milhões de leituras por sequência. A sua facilidade de utilização, compatibilidade com vários kits e softwares, bem como a sua adaptabilidade, tornam este sistema uma escolha estratégica para laboratórios que procuram uma plataforma de sequenciamento de alto desempenho sem sacrificar a flexibilidade.