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Sistema de sequenciamento NovaSeq 6000 - Bom estado 2017

O NovaSeq 6000 da Illumina é um sistema de sequenciamento de última geração projetado para oferecer um poder de descoberta excepcional. Graças à sua flexibilidade, rapidez e capacidade de evolução, permite realizar estudos genómicos complexos, tais como sequenciamento do genoma completo, exoma profundo ou transcriptoma completo. Compatível com vários tipos de células de fluxo e métodos de preparação de bibliotecas, adapta-se a todas as necessidades de investigação. A sua interface intuitiva, os cartuchos prontos a usar e a integração com as ferramentas de análise da Illumina tornam-no uma solução eficaz e fiável para laboratórios.



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Descrição

NovaSeq 6000: sequenciação escalável para todas as aplicações genómicas

O NovaSeq 6000 da Illumina representa um grande avanço no campo do sequenciamento de alto rendimento. Concebido para responder às exigências dos projetos de investigação mais ambiciosos, combina uma tecnologia comprovada de sequenciamento por síntese (SBS) com uma arquitetura flexível que permite adaptar a produção de dados, o tempo de análise e o custo por amostra de acordo com as necessidades específicas de cada estudo.

Graças aos seus quatro tipos de células de fluxo (SP, S1, S2, S4), o NovaSeq 6000 permite modular o fluxo de sequenciamento, o comprimento da leitura e o número de amostras por execução. Assim, é possível realizar tanto estudos de baixa intensidade quanto projetos de sequenciamento do genoma completo em grande escala. O sistema pode funcionar com uma ou duas células de fluxo simultaneamente, oferecendo uma produção de dados de até 6 terabytes e 20 mil milhões de leituras em menos de dois dias.

O NovaSeq 6000 oferece dois fluxos de trabalho de carregamento: o padrão, com geração automatizada de clusters a bordo, e o NovaSeq Xp, que permite o carregamento individual de vias para separar projetos ou maximizar a multiplexação. Este último permite carregar até 384 amostras numa célula S4, reduzindo a quantidade de ADN necessária.

Compatível com uma vasta gama de kits de preparação de bibliotecas Illumina, o NovaSeq 6000 suporta vários métodos, tais como sequenciação do genoma completo, sequenciação direcionada, RNA-seq e epigenómica. Ele se integra perfeitamente a um fluxo de trabalho completo, incluindo gerenciamento de amostras via BaseSpace Clarity LIMS, preparação automatizada de bibliotecas, sequenciamento, análise de dados com BaseSpace Sequence Hub e DRAGEN Bio-IT Platform, e interpretação via TruSight Software Suite.

O seu design engenhoso baseia-se numa tecnologia de células de fluxo com nanoprobes, ótica de alta resolução e amplificação por exclusão, garantindo uma elevada densidade de clusters e uma qualidade de dados ideal. Os consumíveis RFID, os cartuchos prontos a usar e a interface tátil intuitiva simplificam a utilização e reduzem o tempo de manuseamento.

Tecnologia de ponta para uma qualidade de dados excecional

O NovaSeq 6000 utiliza a tecnologia SBS da Illumina com terminadores reversíveis, permitindo a sequenciação paralela de milhares de milhões de fragmentos de ADN. Este método reduz os erros relacionados com homopolímeros e garante uma leitura precisa das bases. As células de fluxo com nanoprobes contêm milhares de milhões de poços em locais fixos, otimizando o espaçamento dos clusters e aumentando a densidade de sequenciação.

A ótica do sistema permite uma varredura rápida e de alta resolução, contribuindo para tornar o NovaSeq 6000 a plataforma Illumina com melhor desempenho em termos de fluxo. A amplificação por exclusão maximiza a ocupação dos poços por clusters provenientes de um único fio de ADN, aumentando consideravelmente a produção de dados.

Fluxo de trabalho integrado e automatizado para máxima eficiência

O NovaSeq 6000 integra-se num ecossistema completo de sequenciação, incluindo:

  • BaseSpace Clarity LIMS: gestão de amostras e reagentes, automatização de fluxos de trabalho, interface intuitiva.
  • Preparação automatizada de bibliotecas: métodos qualificados Illumina com parceiros em robótica.
  • Análise de dados: BaseSpace Sequence Hub, DRAGEN Bio-IT Platform, geração de ficheiros FASTQ.
  • Interpretação: TruSight Software Suite para doenças genéticas, BaseSpace Correlation Engine para comparação com bases de dados públicas.

Características

  • Sequencing by Synthesis (SBS) com terminadores reversíveis
  • Células de fluxo com nanoprobes para alta densidade de clusters
  • Interface tátil intuitiva e ecrã LED
  • Cartuchos de reagentes prontos a usar
  • Geração automatizada de clusters a bordo
  • Compatibilidade com o fluxo de trabalho NovaSeq Xp para multiplexação
  • Redução de 80% nos consumíveis em comparação com o HiSeq
  • Reagentes com identificação RFID para rastreabilidade
  • Integração com BaseSpace e DRAGEN para análise rápida
  • Ampla compatibilidade com os kits de preparação Illumina

Detalhes técnicos

Célula de fluxo SP

  • Linhas: 2
  • Saída:
    • 2 × 50 bp: 65–80 Gb
    • 2 × 100 bp: 134–167 Gb
    • 2 × 150 bp: 200–250 Gb
    • 2 × 250 bp: 325–400 Gb
  • Leituras PE: 1,3–1,6 mil milhões
  • Qualidade: Q30 ≥85% (100/150 bp), Q30 ≥75% (250 bp)
  • Tempo de execução: 13–38 h, dependendo do comprimento da leitura

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Célula de fluxo S1

  • Linhas: 2
  • Saída:
    • 2 × 50 bp: 134–167 Gb
    • 2 × 100 bp: 266–333 Gb
    • 2 × 150 bp: 400–500 Gb
  • Leituras PE: 2,6–3,2 mil milhões
  • Qualidade: Q30 ≥85%
  • Tempo de execução: 13–25 h

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Célula de fluxo S2

  • Linhas: 2
  • Saída:
    • 2 × 50 bp: 333–417 Gb
    • 2 × 100 bp: 667–833 Gb
    • 2 × 150 bp: 1000–1250 Gb
  • Leituras PE: 6,6–8,2 mil milhões
  • Qualidade: Q30 ≥85%
  • Tempo de execução: 16–36 h

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Célula de fluxo S4

  • Linhas: 4
  • Saída:
    • 2 × 100 bp: 1600–2000 Gb
    • 2 × 150 bp: 2400–3000 Gb
  • Leituras PE: 16–20 mil milhões
  • Qualidade: Q30 ≥85%
  • Tempo de execução: 36–44 h

Acessórios compatíveis

  • NovaSeq Xp Flow Cell Dock
  • NovaSeq Xp 2-Lane Kit v1.5
  • NovaSeq Xp 4-Lane Kit v1.5
  • Kits de reagentes SP, S1, S2, S4 (100, 200, 300, 500 ciclos, dependendo do modelo)
  • BaseSpace Clarity LIMS
  • Plataforma DRAGEN Bio-IT
  • Suíte de software TruSight
  • BaseSpace Sequence Hub e Correlation Engine

Logística

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