EXQuest Spot Cutter de Bio-Rad : découpe automatisée des protéines sur gels et membranes
Le EXQuest Spot Cutter de Bio-Rad est un instrument de haute précision destiné à la localisation et à l’excision de spots et de bandes protéiques issus de gels électrophorétiques ou de membranes. Ce système complet permet non seulement de découper les protéines d’intérêt avec rigueur, mais aussi de les transférer directement dans des microplaques pour un traitement et une analyse ultérieurs. Conçu pour réduire le temps consacré aux manipulations manuelles, il offre une reproductibilité optimale, ce qui le rend indispensable dans les laboratoires de recherche en protéomique et en biologie moléculaire.
Le dispositif fonctionne avec différents types de gels et de colorations, qu’elles soient visibles, comme le bleu Coomassie ou l’argent, ou fluorescentes, comme les colorants SYPRO Ruby et SYPRO Orange. Grâce à une conception robuste et une interface simple d’utilisation, le système garantit des résultats fiables tout en préservant l’intégrité des échantillons, étape cruciale avant leur identification par spectrométrie de masse.
Un système intégré alliant imagerie et robotique
Le EXQuest Spot Cutter combine plusieurs technologies dans une plateforme compacte et sécurisée. Son système d’imagerie repose sur une caméra CCD haute résolution équipée de filtres spécifiques pour détecter les taches protéiques avec une sensibilité optimale. La zone de travail est protégée de la lumière ambiante afin d’assurer une qualité constante des images, en particulier pour les gels fluorescents.
Le dispositif intègre également un système fluidique pour le lavage des têtes de coupe et la gestion des déchets, évitant ainsi toute contamination croisée entre les échantillons. Une station de lavage dédiée nettoie automatiquement les pointes de découpe après chaque opération, garantissant un rendement constant. La robotique de précision permet de déplacer la tête de coupe entre le gel, la microplaque et la station de lavage avec une exactitude micrométrique.
Le gel est maintenu sur un plateau spacieux équipé de pinces et de feuilles protectrices qui préservent la surface contre l’usure. Selon les besoins, l’appareil peut être équipé d’une tête de coupe pour gels ou membranes, les deux utilisant des pointes interchangeables de différents diamètres. Ces options permettent de travailler aussi bien sur des gels 2D volumineux que sur des blots de type PVDF ou nitrocellulose.
Optimisation du flux de travail en protéomique
Au-delà de sa précision mécanique, le EXQuest Spot Cutter s’appuie sur les logiciels PDQuest et Quantity One, qui assurent la gestion des images, la création de listes de découpe et le suivi des échantillons. Ces logiciels permettent de superposer les images de gels, de sélectionner automatiquement ou manuellement les zones à exciser et d’exporter les coordonnées. Les échantillons sont ensuite délivrés directement dans des plaques 96 ou 384 puits, compatibles avec les protocoles standards de digestion enzymatique et d’analyse par spectrométrie de masse.
Cette automatisation réduit considérablement les erreurs humaines et améliore la productivité. Les chercheurs peuvent importer des listes de découpe à partir de différentes sources, vérifier la qualité des excisions et, si nécessaire, relancer une opération sur des spots non récupérés. L’intégration d’un lecteur de codes-barres en option renforce encore la traçabilité et facilite la gestion de grands volumes d’échantillons.
En regroupant imagerie, découpe robotisée et gestion logicielle, le EXQuest Spot Cutter constitue une solution complète qui accélère les analyses protéomiques et fiabilise la préparation des échantillons. Il s’impose ainsi comme un outil de référence dans les laboratoires cherchant à optimiser leurs flux de travail tout en assurant des résultats reproductibles et exploitables pour des recherches de haut niveau.
