Génération de clusters simplifiée avec le cBot d’Illumina
Le cBot d’Illumina joue un rôle central dans le flux de travail de séquençage de nouvelle génération, en remplaçant les méthodes traditionnelles et chronophages par une solution automatisée compacte et performante. Ce système permet de créer des clusters clonaux à partir de modèles d’ADN simple brin grâce à une amplification en pont isothermique directement réalisée dans une cellule de flux scellée, évitant toute manipulation fréquente et les risques de contamination associés aux méthodes par PCR en émulsion.
Le cBot permet de préparer des modèles de séquençage à partir de plus de 96 échantillons en seulement 4 à 5 heures, contre plus de 24 heures pour les techniques plus anciennes. La durée d’intervention manuelle est inférieure à 10 minutes, ce qui libère du temps pour d’autres activités en laboratoire. Son logiciel intuitif, combiné à un écran tactile de 8 pouces, propose une navigation guidée étape par étape et une surveillance en temps réel de la progression. Il est également possible de suivre et gérer plusieurs cBot à distance via navigateur ou smartphone, avec des notifications envoyées en cas de fin de cycle ou de nécessité d'intervention.
Le système repose sur des réactifs TruSeq pré-emballés en plaques de 96 puits, éliminant ainsi les erreurs de préparation, les besoins de stockage complexes, et les sources potentielles de contamination. L’intégration d’un manifold à perçage automatique et de connexions thermiques uniformes contribue à une densité de clusters optimale, sans ajout d’équipement externe. La génération de clusters aboutit à plus de 200 millions d’agrégats par cellule de flux, chacun contenant environ 1 000 molécules, prêts à être séquencés avec une grande précision.
Le processus repose sur l’immobilisation de l’ADN sur une surface fonctionnalisée, suivie d’une amplification clonale, d’un blocage des extrémités 3', et de l’hybridation de l’amorce de séquençage. Grâce à cette méthodologie rigoureuse, le cBot garantit une production efficace, reproductible et fiable de modèles d’ADN pour les plateformes de séquençage Illumina.
