Agilent 5200 Fragment Analyzer – Analyse rapide et précise de l’ADN/ARN à haut débit
Le 5200 Fragment Analyzer d’Agilent est un système de capillaire électrophorèse (CE) entièrement automatisé destiné à la séparation et à la quantification d’acides nucléiques double brin, qu’il s’agisse d’ADN ou d’ARN. Sa technologie repose sur l’utilisation d’un faisceau d’électrophorèse appliqué à un réseau de capillaires en silice fondue, chacun étant rempli d’une matrice conductrice spécifique. Cette matrice est optimisée pour trier les molécules selon leur taille, offrant ainsi une visualisation précise de la distribution des fragments présents dans les échantillons. La séparation est obtenue rapidement grâce à l’application d’un champ électrique, les plus petits fragments migrant plus vite que les plus grands.
Le système intègre un module de détection par fluorescence basé sur une source lumineuse LED haute intensité, focalisée sur la fenêtre de détection du capillaire. Les fragments d’ADN ou d’ARN marqués par un colorant intercalant fluorescent sont détectés par une caméra CCD haute sensibilité, générant des électrophorégrammes numériques exploitables en temps réel. La précision de la mesure permet d’obtenir des profils de migration nets et reproductibles, indispensables pour les applications en génomique, transcriptomique ou contrôle qualité de préparations d’échantillons.
La conception du 5200 Fragment Analyzer privilégie la flexibilité et l’efficacité. Il peut être configuré avec un réseau de 12, 48 ou 96 capillaires, s’adaptant ainsi au volume d’échantillons à analyser. Les plaques 96 puits se chargent facilement grâce à un système de tiroirs ergonomiques, chacun dédié à une fonction précise (tampon, marqueur, échantillons, déchets). Cette architecture simplifie la manipulation et réduit le risque d’erreurs de positionnement, tout en maintenant un haut niveau de sécurité grâce à des systèmes d’interverrouillage empêchant toute ouverture inappropriée pendant les opérations haute tension.
L’automatisation complète du processus d’analyse est assurée par le logiciel Fragment Analyzer associé, compatible avec l’outil ProSize pour l’interprétation des données. Les utilisateurs peuvent configurer et lancer leurs séquences d’analyses, surveiller les séparations en direct, et exploiter les résultats via des rapports automatisés. L’interface graphique facilite le suivi des méthodes, le contrôle des paramètres et l’intégration des données, garantissant une prise en main rapide même pour les opérateurs non spécialisés.
Le module de pompage haute pression intégré assure la préparation et le conditionnement automatiques des capillaires entre chaque série d’analyses. Cette étape, qui inclut le rinçage, le remplissage en gel de séparation et l’élimination des résidus, prolonge la durée de vie des capillaires et garantit des performances constantes. Le système offre également le choix entre injection électrocinétique ou par aspiration sous vide, ce qui est particulièrement utile pour les échantillons riches en sels ou contenant des inhibiteurs potentiels.
Compact et robuste, le 5200 Fragment Analyzer trouve sa place dans les laboratoires de recherche, les plateformes de séquençage ou les unités de contrôle qualité. Son encombrement réduit et son faible poids facilitent son intégration dans différents environnements. Il constitue un outil fiable pour les applications nécessitant une séparation fine et une analyse quantitative précise des fragments d’ADN ou d’ARN, telles que la préparation d’échantillons pour le séquençage nouvelle génération, la vérification de la taille de fragments génomiques, ou le contrôle de la qualité d’ARN total extrait.
