HiSeq 2500 : une plateforme de séquençage puissante et adaptable pour la recherche génomique
Le HiSeq 2500 d’Illumina est une plateforme de séquençage conçue pour répondre aux besoins des laboratoires de recherche qui doivent traiter de grands volumes de données avec précision et rapidité. Il s’impose comme une solution de référence pour les centres génomiques et les institutions scientifiques majeures à travers le monde. Ce système prend en charge une grande variété de projets, allant de l’analyse d’expressions géniques à la cartographie de génomes entiers, tout en offrant des performances constantes et fiables.
L’un des atouts majeurs du HiSeq 2500 réside dans sa capacité à s’adapter à différents types d’analyses grâce à ses deux modes de fonctionnement distincts : le mode rapide (rapid-run) et le mode haut débit (high-output). En mode rapide, il permet de réaliser un séquençage complet en seulement 7 heures, ce qui en fait un choix pertinent pour les études nécessitant des résultats immédiats. En mode haut débit, il est capable de traiter jusqu’à 1 térabase de données, correspondant à l’analyse simultanée de plusieurs génomes humains avec une couverture de 30x. Cette flexibilité permet aux utilisateurs d’optimiser leur workflow selon la taille de l’échantillon et la profondeur de lecture souhaitée.
Le système repose sur la technologie de séquençage par synthèse (SBS), une méthode éprouvée basée sur des terminateurs réversibles, qui assure une lecture base par base avec un faible taux d’erreur. Cette technologie permet de limiter les biais d’incorporation et d’assurer une qualité constante, y compris dans les régions répétées ou riches en homopolymères. Plus de 85 % des bases générées par le HiSeq 2500 atteignent un score de qualité Q30 ou supérieur, garantissant une fidélité élevée des résultats.
L’interface utilisateur du HiSeq 2500 a été pensée pour simplifier la prise en main. Grâce au logiciel HiSeq Control Software (HCS), les chercheurs bénéficient d’un guidage pas-à-pas pour chaque phase du processus, depuis la préparation de l’expérience jusqu’au lavage final. Les statistiques de qualité peuvent être consultées en temps réel via le logiciel ou à distance via la plateforme cloud BaseSpace. Cette dernière offre également des outils d’analyse et un App Store dédié pour accéder à des applications tierces.
Le HiSeq 2500 est compatible avec les kits Nextera et TruSeq pour la préparation des bibliothèques, ce qui lui permet de s’intégrer facilement dans des workflows variés, incluant le séquençage du génome entier, l’exome, la transcriptomique et l’épigénomique. Les solutions de stockage et d’analyse, telles que BaseSpace ou IlluminaCompute, permettent de mettre en place une infrastructure complète sans exigence informatique préalable.
Le HiSeq 2500 est une solution robuste, précise et hautement configurable, idéale pour les projets de séquençage à grande échelle où le rendement et la qualité sont essentiels.
