Ion PGM™ System : un système de séquençage flexible pour des recherches biomédicales précises
Le Ion PGM™ System de Thermo Fisher Scientific est une plateforme de séquençage qui répond aux besoins des chercheurs impliqués dans l’étude des maladies humaines, la génomique microbienne ou encore l’analyse d’ADN ancien. Il se distingue par sa capacité à fournir des résultats fiables et reproductibles, tout en s’adaptant à une variété d’applications grâce à une large gamme de puces et à des solutions logicielles intégrées. Le système est particulièrement utilisé dans les domaines de la recherche sur le cancer, les maladies héréditaires, l’épigénomique, la métagénomique, ou encore la génomique agricole.
Le séquenceur Ion PGM™ permet d’exécuter des protocoles de séquençage ciblé d’ADN et d’ARN, d’effectuer des analyses de nombre de copies, de séquencer de novo des génomes microbiens, ou de procéder à des typages bactériens et viraux. Il prend également en charge la vérification de SNP, le séquençage de petits ARN, les analyses ChIP et la méthylation. Pour répondre à ces besoins, plusieurs solutions de sélection de cibles sont disponibles, telles que les technologies Ion AmpliSeq™ ou Ion TargetSeq™, ainsi que des kits de préparation de bibliothèques compatibles avec jusqu’à 384 codes-barres via le logiciel Torrent Suite™.
Le système est composé de deux éléments : le séquenceur Ion PGM™ et le serveur Ion Torrent™, sous forme d’une tour informatique autonome. Ce dernier exécute les traitements de signal, l’appel de bases, l’alignement et l’identification des variants. Le logiciel Ion Reporter™ peut être utilisé en complément pour fournir une annotation et un rapport détaillés des résultats, adaptés aux analyses simples ou comparatives (ex : tumeur normale vs. tumeur mutée).
Avec sa conception compacte et sa compatibilité avec plusieurs types de puces, le Ion PGM™ permet aux utilisateurs de choisir le niveau de débit le plus adapté à leurs projets : de quelques centaines de milliers à plusieurs millions de lectures par séquence. Sa facilité d’utilisation, sa compatibilité avec de nombreux kits et logiciels, ainsi que son adaptabilité font de ce système un choix stratégique pour les laboratoires recherchant une plateforme de séquençage performante sans sacrifier la souplesse.
