NovaSeq 6000 : Séquençage évolutif pour toutes les applications génomiques
Le NovaSeq 6000 d’Illumina représente une avancée majeure dans le domaine du séquençage haut débit. Conçu pour répondre aux exigences des projets de recherche les plus ambitieux, il combine une technologie éprouvée de séquençage par synthèse (SBS) avec une architecture flexible permettant d’adapter la production de données, le temps d’analyse et le coût par échantillon selon les besoins spécifiques de chaque étude.
Grâce à ses quatre types de cellules de flux (SP, S1, S2, S4), le NovaSeq 6000 permet de moduler le débit de séquençage, la longueur de lecture et le nombre d’échantillons par run. Il est ainsi possible de réaliser aussi bien des études de faible intensité que des projets de séquençage du génome entier à grande échelle. Le système peut fonctionner avec une ou deux cellules de flux simultanément, offrant une production de données allant jusqu’à 6 téraoctets et 20 milliards de lectures en moins de deux jours.
Le NovaSeq 6000 propose deux workflows de chargement : le standard, avec génération automatisée de clusters à bord, et le NovaSeq Xp, qui permet un chargement individuel des voies pour séparer les projets ou maximiser le multiplexage. Ce dernier permet de charger jusqu’à 384 échantillons sur une cellule S4, tout en réduisant la quantité d’ADN nécessaire.
Compatible avec une large gamme de kits de préparation de bibliothèques Illumina, le NovaSeq 6000 prend en charge des méthodes variées telles que le séquençage du génome entier, le séquençage ciblé, l’ARN-seq et l’épigénomique. Il s’intègre parfaitement dans un flux de travail complet incluant la gestion des échantillons via BaseSpace Clarity LIMS, la préparation automatisée des bibliothèques, le séquençage, l’analyse des données avec BaseSpace Sequence Hub et DRAGEN Bio-IT Platform, et l’interprétation via TruSight Software Suite.
Son design ingénieux repose sur une technologie de cellules de flux à nanopuces, une optique haute résolution et une amplification par exclusion, garantissant une densité de clusters élevée et une qualité de données optimale. Les consommables RFID, les cartouches prêtes à l’emploi et l’interface tactile intuitive simplifient l’utilisation et réduisent le temps de manipulation.
Technologie de pointe pour une qualité de données exceptionnelle
Le NovaSeq 6000 utilise la technologie SBS d’Illumina avec terminateurs réversibles, permettant le séquençage parallèle de milliards de fragments d’ADN. Cette méthode réduit les erreurs liées aux homopolymères et assure une lecture précise des bases. Les cellules de flux à nanopuces contiennent des milliards de puits à emplacements fixes, optimisant l’espacement des clusters et augmentant la densité de séquençage.
L’optique du système permet un balayage rapide et haute résolution, contribuant à faire du NovaSeq 6000 la plateforme Illumina la plus performante en termes de débit. L’amplification par exclusion maximise l’occupation des puits par des clusters issus d’un seul brin d’ADN, augmentant considérablement la production de données.
Flux de travail intégré et automatisé pour une efficacité maximale
Le NovaSeq 6000 s’intègre dans un écosystème complet de séquençage, incluant :
- BaseSpace Clarity LIMS : gestion des échantillons et des réactifs, automatisation des workflows, interface intuitive.
- Préparation automatisée des bibliothèques : méthodes qualifiées Illumina avec partenaires en robotique.
- Analyse des données : BaseSpace Sequence Hub, DRAGEN Bio-IT Platform, génération de fichiers FASTQ.
- Interprétation : TruSight Software Suite pour les maladies génétiques, BaseSpace Correlation Engine pour la comparaison avec des bases de données publiques.
